Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3aP23116 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms