Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ifna9P09235 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms