Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Psmb10O35955 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms