Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms