Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms