Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Slc6a20aQ8VDB9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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