Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms