Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KNDC1Q76NI1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNDC1Q76NI1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms