Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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