Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms