Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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