Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC006153.1-201ENST00000480135 371 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ANKS1B-205ENST00000546568 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms