Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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