Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXNP49023 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXNP49023 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXNP49023 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXNP49023 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXNP49023 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PXNP49023 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PXNP49023 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms