Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RargP18911 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RargP18911 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RargP18911 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RargP18911 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms