Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18525 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18525 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18525 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms