Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK1O94907 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK1O94907 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK1O94907 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms