Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms