Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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