Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms