Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cpsf3Q9QXK7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cpsf3Q9QXK7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cpsf3Q9QXK7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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