Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms