Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp12Q9D9M2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp12Q9D9M2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp12Q9D9M2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp12Q9D9M2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp12Q9D9M2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp12Q9D9M2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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