Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ms4a4dQ99N05 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ms4a4dQ99N05 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ms4a4dQ99N05 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms