Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS6Q96GS4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms