Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT1Q96EB6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms