Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfdQ925I7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms