Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms