Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms