Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms