Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm21748Q3UE70 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21748Q3UE70 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21748Q3UE70 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21748Q3UE70 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21748Q3UE70 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21748Q3UE70 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21748Q3UE70 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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