Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col24a1Q30D77 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col24a1Q30D77 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col24a1Q30D77 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col24a1Q30D77 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col24a1Q30D77 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Col24a1Q30D77 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col24a1Q30D77 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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