Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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