Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITSN1Q15811 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITSN1Q15811 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms