Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms