Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A3Q01959 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms