Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms