Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms