Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gnb1P62874 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms