Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms