Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Bace1P56818 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bace1P56818 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms