Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MipP51180 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MipP51180 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MipP51180 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
MipP51180 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MipP51180 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MipP51180 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MipP51180 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms