Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ggta1P23336 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms