Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Eb1P04230 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms