Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNMO15061 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNMO15061 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNMO15061 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNMO15061 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNMO15061 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms