Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Myo5cE9Q1F5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Myo5cE9Q1F5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Myo5cE9Q1F5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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