Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms