Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc97Q9DBT3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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