Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sik1Q60670 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sik1Q60670 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms