Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnl1Q52KE7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms